Исследование сложнее провести, если на коже в проекции изучаемого органа есть обширные воспалительные поражения, ожоги, некоторые дерматологические заболевания, которые мешают плотному контакту датчика с кожей. Но на практике это редко мешает проведению УЗИ, поскольку положение датчика можно менять.
Трансвагинальное УЗИ малого таза не рекомендуют делать после некоторых гинекологических операций, а также, девушкам, не живущим половой жизнью.
Трансабдоминальное УЗИ простаты и органов малого таза, требующее наполнения мочевого пузыря, не рекомендуют проводить при недержании мочи и после операций на мочевом пузыре.
Информативность ультразвукового исследования органов брюшной полости снижается, если оно проводится не на голодный желудок, при повышенном газообразовании.